Dwa podrodzaje Price et al. w 1998 r. zrewidował systematykę rodzaju i wyodrębnił 111 gatunków. Podział ten był w 90% zgodny z zaproponowanym przez Farjona (2001), który wyróżnił 109 gatunków.
Następnie analiza sekwencji DNA (Liston et al., 1999, 2003; Gernandt et al., 2001) i chloroplastowego DNA (Wang et al., 1999; Geada López et al., 2002; Gernandt et al., 2003, 2005) potwierdziły podział na dwa podrodzaje, ale zredukowały liczbę podsekcji, chociaż żaden z nowych podziałów nie jest uznawany za dominujący. Wietnamski gatunek P. krempfii posiada specyficzne spłaszczone igły i unikatową budowę anatomiczną drewna. Na tej podstawie rozważany był jako trzeci podrodzaj, ale wyniki badań genetycznych sugerują, że powinien być umieszczony w podrodzaju Strobus.
W podejściu kladystycznym na podstawie badań genetycznych wyróżnia się dwa podrodzaje: podrodzaj Pinus L. – liczący ok. 73 gatunków (2–6 igielne) podrodzaj Strobus Lemmon (syn. Apinus Necker, Caryopitys Small, Ducampopinus A. Cheval., Strobus Opiz) – liczący ok. 43 gatunków (1–5 igielne)
Kladogram rodzaju sosna:
Podrodzaj Strobus Kladogram sekcji Quinquefoliae
Kladogram sekcji Parrya
Podrodzaj Pinus Kladogram sekcji Trifoliae
Kladogram sekcji Pinus
Trzy podrodzaje Historyczny podział rodzaju bazujący na wcześniejszych pracach Price et al.