Selektywność kompleksowania kationów jednowartościowych przez walinomycyny jest następująca: > > > > > > .
Walinomycyna kompleksuje kationy metali drugiej grupy układu okresowego ze wzrastająca selektywnością: > > > .
Najnowsze badania pokazują, że jonofor ten tworzy kompleksy z dwuwartościowymi kationami metali przejściowych takimi jak: , , , , , , i .
Obliczone stałe trwałości dla niektórych kompleksów maleją w szeregu: > > , > > , > .
Mechanizm działania antybiotycznego thumb|left|Schemat transportu jonów i przez walinomycynę w poprzek błony lipidowej Wyjaśnienie mechanizmu kompleksowania kationu potasu przez walinomycynę było niezbędne do zrozumienia procesu transportu tego kationu przez błonę wewnętrzną mitochondrium i wpływu na proces fosforylacji oksydacyjnej. Mechanizm działania antybiotycznego walinomycyny wynika bowiem z selektywnego transportu kationów potasu przez błonę lipidową z macierzy mitochondrialnej do przestrzeni międzybłonowej tego organellum. Transport ten zakłóca naturalny gradient stężenia kationów po obu stronach błony powodując zaburzenia procesów energetycznych komórki.