Sukces komercyjny „Check on It” w dwunastym tygodniu obecności na „Billboard” Hot 100 dotarł na szczyt listy, na którym pozostawał przez pięć tygodni. Stał się tym samym trzecim singlem numer jeden w solowej twórczości Beyoncé oraz pierwszym w dorobku Slim Thuga. „Check on It”, wraz z „Bad Day” Daniela Powtera, była najdłużej utrzymującą się na 1. pozycji piosenką 2006 roku w Stanach ZjednoczonychNo Budging Beyoncé From Hot 100 No. 1Chart Beat. Poza tym singel zajął wysokie miejsca na innych amerykańskich listach: 1. na Rhythmic Top 40, Hot Dance Club Play i Pop 100 (pierwszy utwór Knowles, który w ogóle znalazł się w tym zestawieniu) oraz 3. na Hot R&B/Hip-Hop Songs. „Check on It” była ósmą najczęściej emitowaną na antenach stacji radiowych piosenką 2006 roku z odtworzeń w Stanach Zjednoczonych. Singel uzyskał w tym kraju platynowy status za sprzedaż powyżej kopii.
Na arenie międzynarodowej singel odniósł podobny sukces, plasując się w pierwszych piątkach notowań w Norwegii i Holandii oraz w czołowych dziesiątkach w europejskiego zestawienia, Austrii, Szwajcarii i Brazylii. W Wielkiej Brytanii zadebiutował na 4.