W tym czasie Hitler wypowiedział się o nim słowami: „To mógłby być kiedyś mój następca”.
8 lutego 1945 w okolicach Lubusza został zestrzelony i ciężko ranny. Amputowano mu prawe podudzie, jednak 4 kwietnia (lub 25 marca) powrócił z niezagojonym kikutem prawego podudzia do swojej jednostki i latał do samego końca wojny. Później, mając już protezę nogi, zniszczył jeszcze 26 czołgów. 19 kwietnia 1945, dzień przed ostatnimi urodzinami Hitlera, Rudel spotkał się z führerem w jego bunkrze pod Kancelarią Rzeszy w Berlinie. Ostatni lot bojowy odbył 8 maja, tuż przed ogłoszeniem kapitulacji Rzeszy. Wystartował z lotniska w pobliżu Pragi w kierunku zachodnim, a następnie wylądował w Kitzingen, na terenie kontrolowanym przez wojska amerykańskie, którym się poddał. Choć władze sowieckie domagały się wydania Rudla w ich ręce, oskarżając go o zbrodnie wojenne, Amerykanie odmówili.
Podsumowanie osiągnięć W sumie Rudlowi przypisuje się zniszczenie 519 alianckich czołgów. Poza preferowanym Junkersem Ju 87 G, Rudel latał także na Focke-Wulfie Fw 190 przystosowanym do atakowania celów naziemnych (430 lotów bojowych). Oprócz czołgów miał potwierdzone zniszczenie ok.