Historia współczesna W okresie okupacji nazistowskiej w synagodze przechowywano mienie skonfiskowane żydowskim gminom. W 1955 roku budynek przejęło Muzeum Żydowskie i wykorzystywało go jako magazyn. Po rekonstrukcji w latach 60. XX wieku urządzono w nim ekspozycję srebrnych przedmiotów rytualnych pochodzących z synagog w Czechach i na Morawach, udostępnianą w latach 1965–1988.
Po kolejnej rekonstrukcji synagogę ponownie otwarto dla zwiedzających w 1996 roku. Od tego czasu prezentuje wystawę poświęconą dziejom Żydów w Czechach i na Morawach od początków osadnictwa do epoki oświecenia. Jej współczesna forma wykorzystuje elementy interaktywne, między innymi prezentacje dawnych druków hebrajskich i model Josefova sprzed jego przebudowy. Wśród eksponatów znajdują się m.in. pierścień z hebrajskim napisem z XII–XIII wieku, zasłona na aron ha-kodesz podarowana przez Mordechaja Maisela, oryginalne pisma rabina Löwa, sztandar praskiej gminy żydowskiej oraz szata grobowa portugalskiego mistyka Szloma Molcho.