W 1993 zadebiutował z zespołem Porno for Pyros. Odniósł on sukces artystyczny i komercyjny, jednak ten drugi nie na taką skalę jak Jane. Po trzech latach została wydana druga płyta tego zespołu – Good God’s Urge. W 1997 nastąpiła reaktywacja Jane’s Addiction, a wraz z nią powstała nowa płyta Kettle Whistle. Zespół jednak wkrótce znów się rozpadł.
Farrell zaczął współpracować z innymi zespołami. Rozpoczął też karierę jako DJ Peretz. W 2002 wydał płytę solową Song Yet to be Sung. W 2003 nastąpiła kolejna reaktywacja Jane’s Addiction, której rezultatem była płyta Strays.
Od 2004 roku Farrell pracuje w ramach projektu Satellite Party (płyta Ultra Payloaded ukazała się 29 maja 2007), w który oprócz jego żony na stałe zaangażowany jest również gitarzysta Nuno Bettencourt. Część muzyki na pierwszą płytę została skomponowana wraz z muzykiem Red Hot Chili Peppers Flea, a głosu do niektórych piosenek użyczyła Fergie.
W 2006 piosenkarz został sklasyfikowany na 67. miejscu listy 100 najlepszych wokalistów wszech czasów według Hit Parader.
Życie prywatne Ze związku z Christine Cagle ma syna Yobela Ari Farrella (ur. 1998).