17 września 2010 roku w wyniku problemów finansowych, klub został wycofany z rozgrywek III ligi, czyli de facto seniorska sekcja piłkarska została rozwiązana. Absencja Pogoni w rozgrywkach piłkarskich nie trwała jednak długo i już w następnym sezonie klub został ponownie zgłoszony do rozgrywek. Reaktywowana sekcja piłkarska odbyła pierwszy trening przed czekającym ich sezonem w klasie okręgowej 12 lipca 2011 roku.
W 2012 roku doszło do połączenia sekcji młodzieżowych MSP "Rataje" Oleśnica oraz Pogoni, w wyniku czego powstała Akademia Piłkarska Oleśnica (w której zawodnicy trenują do ukończenia wieku trampkarza), a w MKS pozostał z dwoma grupami juniorów (młodszymi i starszymi) oraz drużyną seniorską. Zaowocowało to zmianami w zarządzie i restrukturyzacją klubu. Rozwiązano sekcję piłki ręcznej, a jesienią 2013 roku sekcja piłkarska została przeniesiona ze Stowarzyszenia MKS "Pogoń" Oleśnica, do nowo powołanej spółki z o.o..
Występy w II lidze Sezon Pozycja Mecze Punkty Bramki 1994/1995 18 34 14 17-68
Najsłynniejsi zawodnicy