„”.
Pierwsze szkolenia w obozach Al-Ka’idy przeszedł pod koniec 1999 roku.
W czerwcu 2000 roku Ata, posiadający wizę turystyczną do Stanów Zjednoczonych, poleciał do Newark w stanie New Jersey. Szybko przeniósł się na Florydę, gdzie w lipcu rozpoczął szkolenie lotnicze. W latach 2000 i 2001 doskonalił swoje umiejętności lotnicze. Otrzymywał również duże sumy pieniędzy z zagranicy i w tych latach intensywnie podróżował, w tym za granicę i często przemieszczał się po Stanach Zjednoczonych.
W maju 2001 Muhammad Ata wraz z drugim mężczyzną odwiedzili lotnisko Boston Logan, gdzie wewnątrz budynku wykonywali fotografie i filmowali punkt kontrolny, co było podejrzane i zwróciło uwagę kilku pracowników, którzy powiadomili o tym ochronę, ale ta zignorowała ich apele. Lotnisko nie miało wtedy nawet kamery w tym pomieszczeniu, więc nie nagrano ich wizytyPaul Sperry "9/11 terrorists caught testing airport security months before attacks" Nypost.com 05.10.2014 https://nypost.com/2014/10/05/airport-security-ignored-pre-911-warnings-on-hijackers-court-docs/.
W sierpniu 2001 roku Ata spotkał się z innymi potencjalnymi porywaczami w Las Vegas, prawdopodobnie finalizując tam plany porwania.