Odmiana po gruntownej modernizacji (1999–2004) thumb|Mitsubishi Carisma sedan po modernizacji thumb|Mitsubishi Carisma liftback po modernizacji - tył thumb|Deska rozdzielcza z 2003 roku W roku 1999 została zaprezentowana Carisma po gruntownej modernizacji. Zmieniono całkowicie wygląd przodu, tyłu oraz wnętrza. Nie zabrakło także technicznych nowości: silnik benzynowy 1.6 generował moc 99 KM. Wprowadzone zostały nowe oznaczenia wersji wyposażeniowych: Classic, Comfort, Avance i Elegance.
W ofercie silników wysokoprężnych oprócz wysłużonego TD pojawiły się dwie nowe jednostki DI-D z bezpośrednim wtryskiem paliwa, technologią Common-Rail i intercoolerem. Silniki te dostarczał Renault.
W 2000 roku zaktualizowano silnik GDI. Modyfikacje miały na celu obniżenie emisji zanieczyszczeń i osiągnięcie wymogów normy EURO IV. W efekcie uległa zmianie moc - z 125 KM na 122 KM. W tym samym roku Mitsubishi zaprezentowało model Carisma Dynamics. Ze specjalistami z Formuły 1 przemodelowano nadwozie oraz zaopatrzono samochód w felgi o rozmiarze 17 cali. Samochód był napędzany jednostką 1.8 GDI. Tego samego roku zaprzestano sprzedaż Carism z silnikiem 1.9 TD.
W 2001 roku po lekkich zmianach silnik 1.6 osiągał moc 103 KM.