Etap 5. ZawodnikKrajDrużynaCzas1Danilo Di LucaLIQ 5h 01'25"2Janez BrajkovičDSC + 0"3Andriej KaszeczkinAWT + 7"4José Ángel Gómez MarchanteSDV + 15"5Carlos SastreCSC + 22"
Etap 6. ZawodnikKrajDrużynaCzas1Thor HushovdC.A 4h 09' 10"2André GreipelTMO + 0"3Erik ZabelMRM + 0"4Alessandro PetacchiMRM + 0"5Danilo NapolitanoLAM + 0"
Etap 7. CyclistCountryTeamTime1Alejandro ValverdeCEI 4h 01'05"2Carlos SastreCSC + 4"3José Ángel Gómez MarchanteSDV + 6"4Janez BrajkovičDSC + 7"5Manuel BeltránDSC + 7"
Etap 8. ZawodnikKrajDrużynaCzas1Aleksandr WinokurowAWT 4h 02' 11"2Ruggero MarzoliLAM + 1"3Uroš MurnPHO + 1"4Thor HushovdC.A + 1"5Paolo BettiniQSI + 1"
Etap 9. ZawodnikKrajDrużynaCzas1Aleksandr WinokurowAWT 5h 50'43"2Alejandro ValverdeCEI + 16"3Andriej KaszeczkinAWT + 21"4Carlos SastreCSC + 43"5José Ángel Gómez MarchanteSDV + 43"
Etap 10. ZawodnikKrajDrużynaCzas1Sérgio PaulinhoAWT 4h 33'44"2Davide RebellinGST + 2"3Xavier FlorencioBTL +2"4Władimir KarpiecCEI + 6"5Francisco José VentosoSDV + 7"
Etap 11. ZawodnikKrajDrużynaCzas1Egoi MartínezDSC 4h 22'32"2Íñigo LandaluzeEUS + 55"3Wołodymyr HustowCSC + 55"4Thor HushovdC.A + 3' 35"5Aleksandr UsowA2R + 3' 35"
Etap 12. ZawodnikKrajDrużynaCzas1Luca PaoliniLIQ 3h 35'07"2Bart DockxDVL + 5"3Paolo BettiniQSI + 5"4Władimir GusiewDSC + 8"5David ArroyoCEI + 8"