miejsce, a Tapalović 18 razy pojawił się na boisku, ale podobnie jak w Bochum najczęściej był rezerwowym. Miejsce w składzie odzyskał dopiero w sezonie 1999/2000, ale już jako piłkarz TSV 1860 Monachium. W rundzie jesiennej było nieco gorzej, Tapalović znów leczył kontuzję i grał już mniej. Za to TSV osiągnęło duży sukces, jakim było zajęcie 4. miejsca w lidze, co zagwarantowało udział w kwalifikacjach do Ligi Mistrzów w sezonie 2000/2001. Jednak miejsca w składzie Tapalović szybko nie odzyskał. Od listopada 2000 do kwietnia 2001 leczył kontuzję, a w całym sezonie zagrał tylko 10 razy. Na dodatek TSV nie zdołało awansować do Ligi Mistrzów i odpadło w dwumeczu z Leeds United. W lidze zajęło dopiero 11. miejsce. Sezon 2001/2002 był dla Tapalovicia lepszy. W końcu grał w pierwszej jedenastce TSV i trenerzy byli zadowoleni z niego. Latem 2002 powrócił jednak do Bochum, które z Filipem w składzie bez większych problemów zdołało się utrzymać w pierwszej lidze. W sezonie 2003/2004 12 ligowych meczów Tapalovicia nieznacznie pomogło w zajęciu przez VfL 5. miejsca i awansu do Pucharu UEFA. W sezonie 2004/2005 tyle samo razy pojawił się na boisku, a drużyna z Bochum dość niespodziewanie spadła z ligi. Tapaloviciowi skończył się kontrakt i zdecydował się opuścić Niemcy odchodząc do austriackiego FC Wacker Tirol z Innsbrucka.