W maju 1946 otrzymał nominację na profesora nadzwyczajnego Wydziału Teologii Ewangelickiej z Uniwersytetu Warszawskiego, w 1948 objął stanowisko prodziekana, a w 1952 dziekana wydziału. W 1954 roku, po wydzieleniu wydziału z UW i przekształceniu w samodzielną uczelnię teologiczną Chrześcijańską Akademię Teologiczną został jej pierwszym rektorem. W 1956 roku Rada Państwa nadała mu tytuł profesora zwyczajnego. W 1965 zrzekł się funkcji rektora i objął kierownictwo katedry wiedzy nowotestamentowej i języka greckiego, którą kierował aż do przejścia na emeryturę 30 września 1969.
W 1979 roku otrzymał tytuł doktora honoris causa Chrześcijańskiej Akademii Teologicznej w Warszawie50 lat Chrześcijańskiej Akademii Teologicznej 1954–2004, red. Marek Ambroży, Warszawa 2005 , s. 110..
Autor licznych artykułów i rozpraw, jeden z tłumaczy przekładu Biblii znanego jako Biblia warszawska.
Został pochowany na cmentarzu ewangelicko-augsburskim w WarszawieJ. Szturc, Niemczyk Wiktor ks., [w:] Tenże, Ewangelicy w Polsce. Słownik biograficzny XVI–XX w., Wydawnictwo Augustana, Bielsko-Biała 1998, s. 216 . (aleja 13, grób 27a) śp. Wiktor Niemczyk.