W kolejnych dwóch filmach Jordan wraca do Irlandii. W koprodukcji irlandzko-amerykańsko-brytyjskiej powstał biograficzny Michael Collins – jego bohaterem jest autentyczny przywódca IRA z czasów Wolnego Państwa Irlandzkiego. Film zdobył Złotego Lwa na 53. MFF w WenecjiLista nagrodzonych Złotym Lwem i innymi nagrodami głównymi na Międzynarodowym Festiwalu Filmowym w Wenecji [2013-06-02]. Z kolei Chłopak rzeźnika jest przerysowanym obrazem dorastania w Irlandii w latach 60.
W 2002 zrealizował Podwójny blef, będący remake'em czarnego kryminału Bob le flambeur Jean-Pierre Melville’a z połowy lata 50. XX wieku.
Neil Jordan jest członkiem Aosdána, irlandzkiego stowarzyszenia grupującego wybitnych twórców. Zasiadał w jury konkursu głównego na 49. MFF w Wenecji (1992).