Zapamiętany był został zwłaszcza mecz z Realem Oviedo, wygrany przez Valladolid 8:3, kiedy to Peternac zdobył aż 5 bramek. W kolejnym sezonie indywidualny dorobek Alena był już gorszy (tylko 6 goli), ale jego klub zajął 7. miejsce w lidze i awansował do Pucharu UEFA. W kolejnych sezonach (1997/1998 i 1998/1999) Peternac systematycznie był najlepszym strzelcem zespołu i zdobywał odpowiednio 13 i 11 bramek w sezonie. Przełomowy był sezon 1999/2000 – niestety na gorsze. Peternac odniósł kontuzję i zagrał tylko 11 meczów ligowych i nie zdołał zdobyć bramki. Po sezonie odszedł do teoretycznie silniejszego Realu Saragossa, ale i tam nie potrafił przełamać strzeleckiej niemocy. Sezon 2001/2002 spędził w drugoligowym Realu Murcia, natomiast ostatni w swojej karierze – 2002/2003 to tylko 3 mecze w Realu Saragossa. Ogółem w Primera División zdobył 53 bramki w 164 meczach.
Kariera reprezentacyjna W reprezentacji Chorwacji Peternac zadebiutował za selekcjonerskiej kadencji Miroslava Blaževicia, 10 lutego 1999 roku w przegranym 0:1 meczu z reprezentacją Danii.