Komunikacja FDD3000 z komputerem odbywała się za pomocą specjalnego interfejsu wyposażonego m.in. fabrycznie w ROM i (rozszerzalne poprzez wymianę układu scalonego SRAM do ) statycznej pamięci RAM. Jego wąskim gardłem był sam sposób transmisji danych, który odbywał się za pomocą 4-bitowej magistrali w trybie pełnego dupleksu.
TOS Uruchomieniu systemu operacyjnego stacji dysków towarzyszyło uaktywnienie rozszerzenia ROM ZX Spectrum zawartego w pamięci ROM interfejsu (pamięć SRAM pełniła funkcję bufora podczas przesyłania danych ze stacji do komputera oraz przechowywała dodatkowe zmienne systemowe rozszerzenia). Było to możliwe dzięki jednej z linii sterujących szyny systemowej ZX Spectrum, która pozwalała na podmianę wbudowanego ROM-u na zewnętrzną pamięć, umożliwiając w ten sposób rozbudowę BASICa o dodatkowe rozkazy.
TOS (ang. Timex Operating System) w wersji A.2 zapewniał obsługę dodatkowych poleceń oraz błędów związanych z obsługą stacji dyskietek, a w wersji A.4 udostępniał również wygodne GUI z dodatkowymi narzędziami, takimi jak kopiowanie dysków i kaset.