W 1923 zawarł związek małżeński z Wandą z Filipkowskich. Miał z nią syna Krzysztofa Pełczyńskiego, żołnierza pułku AK „Baszta”, który zginął w powstaniu warszawskim oraz córkę Marię Bobrowską z Pełczyńskich, która potem była architektem w Londynie. Ślubu udzielił im ks. Władysław Korniłowicz (1884–1946)W.Baliński, „Człowiek w cieniu”, s.120..
Działalność niepodległościowa Naukę rozpoczął w Szkole Realnej w Łowiczu. W 1905, jako uczeń trzeciej klasy, uczestniczył w strajku szkolnym. Od 1907 należał do Organizacji Młodzieży Narodowej. Naukę kontynuował w Warszawie, w Gimnazjum gen. Pawła ChrzanowskiegoSmolna 30. Gimnazjum im. Jana Zamoyskiego Warszawa: PIW, 1989, s. 338, poz. 35 oraz fot. nr 34 po s. 224., gdzie w 1911 zdał maturę. W tym samym roku podjął studia medyczne na Uniwersytecie Jagiellońskim w Krakowie. W czasie studiów był członkiem Związku Młodzieży Polskiej „Zet”, gdzie w latach 1912–1913 należał do ścisłego kierownictwa (Centralizacji)W.Baliński, „Człowiek w cieniu”, s. 15.. Ponadto jesienią 1912 pracował w Związku Strzeleckim. Od października 1913 do lipca 1914 należał do Polowych Drużyn „Sokoła”. Ukończył kurs wojskowy prowadzony przez Zygmunta Zielińskiego, późniejszego generała broni WP.