Po sezonie 2006/2007 Arsenal nie zdecydował się na transfer definitywny i Baptista wrócił do Madrytu. W tym roku otrzymał hiszpański paszport. 11 sierpnia tego samego roku trafił w ramach transferu definitywnego do włoskiego klubu AS Roma za 9 mln €, z opcją dopłaty jeszcze dwóch milionów euro, w przypadku awansu zespołu z Rzymu w przyszłym sezonie do rozgrywek Ligi Mistrzów.
18 sierpnia 2018 został zawodnikiem rumuńskiego CFR Cluj. 29 maja 2019 ogłosił zakończenie kariery piłkarskiej.
Po zakończeniu kariery w 2021 roku został trenerem rezerw Realu Valladolid, które trenował do sierpnia 2023 kiedy to został zwolniony przez prezesa Realu Valladolid - Ronaldo Nazario.
Sukcesy Real Madryt Mistrz Hiszpanii 2007/08 Superpuchar Hiszpanii 2007/08 Cruzeiro Mistrz Brazylii 2013, 2014
CFR Cluj
Mistrz Rumunii: 2018/19
Reprezentacja Brazylii Copa América: 2004, 2007 Puchar Konfederacji w piłce nożnej: 2005, 2009
Przypisy
Linki zewnętrzne Statystyki w bazie ESPN FC