22 kwietnia 1918 został zwolniony z obozu ze względu na zły stan zdrowia.
Znów w POW Po zwolnieniu z obozu Koc powrócił do działalności konspiracyjnej w Polskiej Organizacji Wojskowej i 22 kwietnia 1918 objął Komendę Naczelną POW nr 1 w Warszawie, obejmującą swoim działaniem obszar okupacji niemieckiej. Przejął ją po Janie Zdanowiczu-Opielińskim, który następnie przekonał Komendanta Głównego POW Edwarda Śmigłego-Rydza, aby ten mianował Koca Komendantem Naczelnym POW na terenie byłego Królestwa Polskiego.
12 czerwca 1918 otrzymał świadectwo odejścia z UJ.