Kierownictwo PSV Eindhoven zdecydowało, że nie przedłużą z nim kontraktu i Thompson w lecie 2006 powrócił do Victory na sezon 2006/2007.
Kariera klubowa w liczbach Sezon Klub Kraj Rozgrywki Mecze Bramki 1996/97 Gippsland Falcons National Soccer League 6 2 1997/98 Gippsland Falcons National Soccer League 15 4 1998/99 Carlton SC National Soccer League 10 5 1999/00 Carlton SC National Soccer League 35 12 2000/01 Carlton SC National Soccer League 8 6 2000/01 Marconi Stallions National Soccer League 13 6 2001/02 Lierse SK Eerste Klasse 31 9 2002/03 Lierse SK Eerste Klasse 5 0 2003/04 Lierse SK Eerste Klasse 25 4 2004/05 Lierse SK Eerste Klasse 29 14 2005/06 Melbourne Victory A-League 15 8 2005/06 PSV Eindhoven Eredivisie 2 0 2006/07 Melbourne Victory A-League 22 15 2007/08 Melbourne Victory A-League 13 7 2008/09 Melbourne Victory A-League 16 8