Z drużyną narodową Fernandez wygrał Euro 1984 – w domu we Francji – i doszedł do półfinału w Mistrzostwach Świata w 1986 roku w Meksyku.
Po eliminacjach do Mistrzostw Świata w 1986 roku i tuż po wygranym Mistrzostwie Francji z PSG, Fernandez podjął decyzję dołączyć do drużyny Jean-Luca Lagardere’a Racing Club de France. Ale w rzeczywistości drużyna była silna tylko na papierze, klub i Fernandez nie działali razem i zostawił Racing na trzy lata. Po Mistrzostwach Świata 1986 francuska drużyna nie zakwalifikowała się na Euro 1988 i Mistrzostwa Świata 1990.
Z Racingu Fernandez przeszedł do AS Cannes w 1989 – bardziej skromnego klubu z przyjaznym otoczeniem. Fernandez był nadal częścią drużyny francuskiej, jednak forma już zanikała. Pod skrzydłami Michela Platiniego, Fernandez mógł grać rolę jokera, który miał ustawić końcowy wynik meczu. Fernandez zagrał na Euro 1992, gdzie Francja odpadła już w fazie grupowej i Fernandez zdecydował zakończyć międzynarodową karierę. Na poziomie klubu AS Cannes spadło do Ligue 2 w końcu sezonu 1991-92, ale Fernandez zdecydował pozostać w klubie i skończyć karierę, gdy jego kontrakt wygaśnie. Ale Fernandez nie uwzględnił wolnego przejścia na emeryturę, kiedy po kilku tygodniach AS Cannes zdecydował zaufać Fernandezowi na stanowisku menedżera.