W 1983 został członkiem PAN, w latach 1993–1996 Wiceprezes i Sekretarz Naukowy PAN.
1 czerwca 1999 roku odbyło się uroczyste wręczenie dyplomu Doktora Honoris Causa Uniwersytetu w BiałymstokuAndrzej Wyczański na stronie UwB.
Zmarł w Warszawie. Pochowany na cmentarzu Stare Powązki (kwatera 85-6-19).
Profil badań naukowych thumb|240px|Grób historyka Andrzeja Wyczańskiego na cmentarzu Stare Powązki w Warszawie W swoich badaniach koncentrował się na historii gospodarczej i społecznej Polski w XVI wieku. Jego najważniejsze prace dotyczyły funkcjonowania gospodarki folwarcznej, konsumpcji żywności oraz struktury społeczeństwa staropolskiego. Nawiązywał w nich do osiągnięć francuskiej szkoły Annales, z którą był związany od lat 50.
Uczniowie Do grona jego uczniów zaliczają się: Alina Czapiuk, Piotr Guzowski, Anna Kamler, Cezary Kuklo, Igor Kąkolewski, Anna Sucheni-Grabowska.