Na afrykańskim czempionacie Honduranie grali w grupie H razem z Hiszpanią, Chile i Szwajcarią. Po bezbramkowym remisie ze Szwajcarami i dwóch porażkach (z reprezentacją Chile 0:1 i Hiszpanią 0:2) z jednym punktem na koncie i zerowym dorobkiem bramkowym zajęli ostatnie miejsce w grupie i odpadli z turnieju.
Cztery lata później udało im się też awansować na mundial w Brazylii. Turniej ten również zakończyli na fazie grupowej, przegrywając wszystkie mecze (odpowiednio z Francją i Szwajcarią po 0:3, oraz Ekwadorem 1:2).
Reprezentacja Hondurasu znana jest również z opisywanej przez Ryszarda Kapuścińskiego wojny futbolowej, krótkotrwałego konfliktu zbrojnego między Salwadorem a Hondurasem, którego zarzewiem był wygrany przez drużynę narodową Salwadoru mecz eliminacji do Mundialu 1970.
Reprezentacja Hondurasu zajmuje obecnie (1 czerwca 2017) 6. miejsce w Federacji CONCACAF.