Po II wojnie światowej dworzec do 1953 roku (inne źródła mówią o 1948) ponownie nosił nazwisko amerykańskiego prezydenta, po czym zmieniono nazwę na Praha hlavní nádraží. Po 1989 roku nazwa ta nadal obowiązuje, choć rzadko stosuje się również nieoficjalną – Nádraží prezidenta Wilsona. Również na niektórych mapach pojawiają się obie nazwy.
W okresie komunistycznym dworzec uzyskał nowy terminal, z którego obecnie korzystają podróżni. W 1974 roku do dworca dotarło metro. Dawne secesyjne hale funkcjonują jako wyższa kondygnacja i mieszczą się w nich m.in. kawiarnie i księgarnia.
Połączenia kolejowe Główny dworzec kolejowy jest międzynarodowym węzłem komunikacyjnym, z wieloma bezpośrednimi liniami dziennymi i nocnymi za granicą. Międzynarodowe linie bezpośrednie obsługują České dráhy we współpracy z przewoźnikami zagranicznymi, połączenia na Słowację obsługują także pociągi RegioJet, Leo Express i ARRIVA, RegioJet kursuje także do Wiednia, Budapesztu i Przemyśla.