z takimi zespołami jak: ...And Oceans, Abaddon Incarnate, Alestorm, Arsis, Augury, Avulsed, Burning Human, Drawn and Quartered, Dreamlore, Engaged in Mutilating, Impaled, Jungle Rot, Krieg, Lazarus A.D., Merciless Terror, MercyKill, Michael Angelo Batio, Novembers Doom, Only Human, Rude Revelation, Secrets She Kept, Sigh, Summon, System Divide, Thanatopsis, The Atlas Moth, Thus Defiled, Vondur, War oraz World Under Blood. Publikował także lekcje gry na gitarze na łamach czasopisma Guitar Player.
W 2001 roku u muzyka zdiagnozowano złośliwy nowotwór mózgu. Po przeprowadzonej operacji Murphy powrócił do zdrowia. W 2011 roku gitarzysta oznajmił, iż wykryto u niego niezłośliwy nowotwór mózgu.
Dyskografia Obituary – Cause of Death (1990, Roadrunner Records) Death – Spiritual Healing (1990, Combat Records) Cancer – Death Shall Rise (1991, Restless Records) Disincarnate – Dreams of the Carrion Kind (1993, Roadrunner Records) Testament – Low (1994, Atlantic Records) Testament – Live at the Fillmore (1995, Burnt Offerings) James Murphy – Convergence (1996, Shrapnel Records) Konkhra – Weed Out the Weak (1997, Diehard) James Murphy – Feeding the Machine (1999, Shrapnel Records) Konkhra – The Freakshow (EP, 1999, Diehard) Testament – The Gathering (1999, Spitfire Records) Konkhra – Come Down Cold (1999, Diehard) Konkhra –