Od 1987 roku był poszukiwany listem gończym. Mimo to (już jako Peter Vogel) w drugiej połowie lat 90. przebywał w Polsce, był częstym gościem Sejmu RP. W 1999 roku został aresztowany w Szwajcarii (już pod zmienionym nazwiskiem Vogel) i w wyniku ekstradycji przekazany do Polski. W lipcu 1999 roku została wszczęta wobec niego budząca kontrowersje procedura ułaskawieniowa ze strony minister Hanny Suchockiej, zakończona ułaskawieniem w trybie nadzwyczajnym przez prezydenta RP Aleksandra Kwaśniewskiego. W Kropce nad i Aleksander Kwaśniewski przyznał, że dopiero po fakcie dowiedział się o czynach Filipczyńskiego. Ułaskawił go, ponieważ jego nazwisko znalazło się na liście prokuratora generalnego Hanny Suchockiej.
Działalność biznesowa Pracował w bankach Coutts Bank i EFG Bank. W 2006 polski prokurator złożył w Szwajcarii kilka wniosków o ujawnienie informacji o kontach, co do których istnieją podejrzenia, że były wykorzystywane do transferowania łapówek. W latach 2002–2006 pośredniczył w dostarczaniu szwajcarskiego sprzętu kryptograficznego dla polskiej łączności rządowej. Peter Vogel 24 marca 2008 roku został zatrzymany przez Centralne Biuro Śledcze Komendy Głównej Policji.