Na podejściach przed stacją znajdują się posterunki odgałęźne Nowa Wieś, Kłodnica, Żabieniec i Stare Koźle ułatwiające prowadzenie ruchu pociągów.
Historia W 1845 uruchomiono linię kolejową Opole – Gliwice (stacja kolejowa w Kędzierzynie nazywała się wówczas Kozel-Kandrzin). Przyspieszyło to rozwój gospodarczy całego regionu.
W 1861 wybudowano bocznicę kolejową do przystani przy Kanale Kłodnickim.
W 1915 wybudowano nowy dworzec kolejowy.
W 1961 zelektryfikowano linię z Kędzierzyna przez Gogolin do Opola, w 1962 do Gliwic, a w latach 1969-1970 do Raciborza i Rybnika. Kędzierzyn był wówczas jednym z najważniejszych węzłów kolejowych na Górnym Śląsku.
W maju 2014 PKP podpisało z konsorcjum firm Eko-Bud i Chem-Bud umowę na remont dworca. Pod koniec 2014 roku PKP zerwało ją ze względu na 3-miesięczne opóźnienie. W maju 2015 PKP podpisało z firmą SKB Development umowę na dokończenie remontu. W ramach remontu dokonano renowacji elewacji, wymiany drzwi i okien oraz remontu wnętrza budynku. W budynku pojawiły się też nowy system informacji pasażerskiej, monitoring i przewijaki dla niemowląt, a przed dworcem stojaki na rowery. Dworzec został w pełni dostosowany do potrzeb osób niepełnosprawnych.