Studia pianistyczne ukończył w krakowskiej Państwowej Wyższej Szkole Muzycznej u Barbary Korytowskiej (1960). W 1962 założył Zespół MW 2, wykonujący muzykę współczesną, często w formie aleatorycznej, happeningu i teatru instrumentalnego. Zespół ten, do którego należą soliści, kameraliści i aktorzy, występował w krajach europejskich, azjatyckich i amerykańskich, dokonał licznych nagrań płytowych, radiowych i telewizyjnych, uczestniczył w kilkudziesięciu międzynarodowych festiwalach muzyki współczesnej (m.in. w 1965 otrzymał nagrodę w konkursie Młodych Wykonawców Muzyki Współczesnej w Utrechcie), festiwalu Poznańska Wiosna Muzyczna (medal Polihymnii, 1978), medal ZKP (1973).
Od 1962 Adam Kaczyński zajmował się pracą pedagogiczną w krakowskiej uczelni muzycznej (od 1979 Akademia Muzyczna). W 1972 objął klasę kameralnej muzyki współczesnej, w latach 1974–1975 przebywał w USA na stypendium Fundacji Fulbrighta. W 1990 założył i został pierwszym kierownikiem Katedry Interpretacji Muzyki Współczesnej. W 1991 otrzymał tytuł profesora.