Stwarzało to trudności dla użytkowników przy uruchamianiu trybu MS-DOS w Windows 95 celem uruchomienia gier z powodu mniejszej ilości dostępnej pamięci konwencjonalnej.

3 dostarczany był też z Windows 95 OSR2, przy czym wiele funkcji było nieaktywnych do momentu instalacji dodatku Plus!. nie mógł też być używany z systemem plików FAT32 przez co był mało użyteczny na komputerach z dużymi dyskami twardymi.

w Windows 98 Windows 98 był rozprowadzany z 3 jako składnikiem systemu. Funkcjonalność była identyczna jak w Windows 95 z Plus!.

w Windows Me Z powodu usunięcia obsługi trybu rzeczywistego, FAT32 stającego się powszechnie stosowanym systemem plików oraz malejącej popularności , w Windows Me miał ograniczone wsparcie. Nie oferował już kompresji dysku twardego, lecz wciąż umożliwiał odczyt i zapis do skompresowanych nośników wymiennych; oprócz tego jedyną możliwą operacją było usuwanie i realokacja skompresowanych dysków.

Istnieje nieoficjalna możliwość przywrócenia pełnej użyteczności 3 w Windows Me poprzez skopiowanie pliku wykonywalnego z instalacji Windows 98 i nadpisanie go na ten dołączony do Windows Me. W rezultacie użytkownik może ponownie skompresować dysk tak jak w Windows 98.