Z powodu odmowy Francuzów, 19 czerwca 1864 „Alabama” została przechwycona przez slup Unii USS „Kearsarge” i doszło do pojedynku obu okrętów. Po około godzinie walki, „Alabama” otrzymała więcej trafień, została opuszczona przez załogę i zatonęła. Ranny komandor Semmes i część rozbitków zostali podjęci przez brytyjski jacht „Deerhound”, przez co uniknęli niewoli.
Po leczeniu w Anglii, Semmes przedarł się do Konfederacji, gdzie w lutym 1865 otrzymał nominację na stopień kontradmirała. Podczas ostatnich miesięcy wojny dowodził eskadrą rzeki James. Pod koniec wojny, razem z marynarzami służył w obronie lądowej, otrzymując stopień generała brygadiera Armii Stanów Skonfederowanych.
Po wojnie, zajmował się m.in. karierą prawniczą. Napisał i opublikował w 1869 książkę Memoirs of Service Afloat During The War Between the States (Wspomnienia ze służby na wodzie podczas Wojny między Stanami), będącą żarliwą obroną sprawy Konfederacji. Obecnie Raphael Semmes jest jedną z postaci galerii sław stanu Alabama (Alabama Hall of Fame).
Zobacz też Okręty noszące nazwę USS „Semmes”
Kategoria:Amerykańscy admirałowie Kategoria:Amerykańscy prawnicy Kategoria:Oficerowie Marynarki Skonfederowanych Stanów Ameryki Kategoria:Urodzeni w 1809 Kategoria:Zmarli w 1877