Rozkwit kariery thumb|350px|left| Alex Zülle na igrzyskach w Atlancie. Rok 1996. W lutym 1995 roku Alex Zülle odniósł zwycięstwo w Volta a la Comunitat Valenciana. W Tour de France uplasował się na drugim miejscu. Przełomowe sukcesy przyszły do Szwajcara w roku 1996. Wiosną zwyciężył w dwóch katalońskich wyścigach - Setmana Catalana oraz Volta a Catalunya. Tour de France rozpoczął od zwycięstwa w prologu w Den Bosch, które zapewniło mu żółtą koszulkę lidera na trzy kolejne dni. Jesienią Zülle zwyciężył w wyścigu Vuelta a España. W klasyfikacji końcowej wyprzedził swoich rodaków Laurenta Dufaux i Tony’ego Romingera. Na zakończenie sezonu zdobył złoty medal mistrzostw świata w jeździe indywidualnej na czas w Lugano. W 1997 roku powtórnie zdołał zwyciężyć w wyścigu Vuelta a España. Przejście do zespołu Festina w 1998 roku miało wzmocnić skład tej drużyny w rywalizacji z niemieckim Telekomem przed nadchodzącą edycją Tour de France. Nowy sezon miał również przynieść pierwszy start kolarza w Giro d’Italia. Alex Zülle rozpoczął ten wyścig od zwycięstwa w prologu na ulicach Nicei. Przez większość wyścigu utrzymywał się na prowadzeniu w klasyfikacji generalnej nosząc różową koszulkę lidera.