Maria Amalia Habsburg (ur. 22 października 1701 w Wiedniu, zm. 11 grudnia 1756 w Monachium) – cesarzowa, królowa Czech, księżna Bawarii, córka cesarza Józefa I Habsburga i Wilhelminy Amalii, córki księcia brunszwickiego Jana Fryderyka Welfa.
5 października 1722 r. poślubiła elektora bawarskiego Karola Alberta (6 sierpnia 1697 – 20 stycznia 1745), syna elektora Maksymiliana II Emanuela i Teresy Kunegundy Sobieskiej, córki króla polskiego Jana III Sobieskiego.
Po śmierci w 1740 r. stryja Marii Amalii, cesarza Karola VI, który nie pozostawił po sobie syna, wybuchła tzw. austriacka wojna sukcesyjna. Jedną ze stron walczących o cesarski tron był mąż Marii Amalii Karol Albert. Został on w 1742 roku ostatecznie wybrany cesarzem jako Karol VII Bawarski. W 1742 roku Marię Amalię koronowano na cesarzową. W 1745 roku została wdową i musiała zrzec się korony na rzecz swojej siostry stryjecznej Marii Teresy. Maria Amalia zmarła 11 grudnia 1756 roku.