Jako pilot doświadczalny brał udział w próbach z nowymi typami samolotów. 1996–1998 – przeszedł kurs w Podyplomowej Szkole Marynarki Wojennej (Naval Postgraduate School) w Monterey w stanie Kalifornia, uzyskując tytuł magistra systemów technicznych. Po zakończeniu nauki zgłosił swój akces do rozpisanego naboru nowych astronautów.
Jako pilot wylatał 1900 godzin.
Kariera kosmonauty 1998 – został jednym z pięciu finalistów podczas drugiego naboru brazylijskich astronautów – specjalistów ładunku. W sierpniu 1998 udał się do Centrum Kosmicznego im. Johnsona (Johnson Space Center) gdzie rozpoczął trening razem z amerykańskimi astronautami wybranymi do grupy . 2000 – po ukończeniu dwuletniego przeszkolenia, podczas którego m.in. opanował wiedzę o systemach pokładowych wahadłowców oraz Międzynarodowej Stacji Kosmicznej Pontes zdał egzamin końcowy uzyskując kwalifikacje astronauty. Po przeszkoleniu przydzielono go do Biura Astronautów NASA do Wydziału ds. Eksploatacji Stacji Kosmicznej (Space Station Operations Branch).