Fobos jest powszechnie uważany za planetoidę przechwyconą przez Marsa. Niektórzy sugerują, że może on nawet pochodzić nie z głównego pasa planetoid, ale z zewnętrznych rejonów Układu Słonecznego. Najnowsze badania jak i współpłaszczyznowość orbity Fobosa, Deimosa i rotacji Marsa sugerują, że księżyce te powstały wskutek impaktu większego ciała z Marsem.
thumb|Fobos na tle tarczy słonecznej, sonda Opportunity
Kratery na Fobosie Kratery na powierzchni Fobosa noszą nazwy związane z postaciami Podróży Guliwera Jonathana Swifta lub też zostały nazwane od astronomów związanych z tym księżycem.
Krater Pochodzenie nazwy Koordynaty Clustril postać z Podróży Guliwera 60°N 91°W D’Arrest Heinrich Louis d’Arrest, astronom 39°S 179°W Drunlo postać z Podróży Guliwera 36,5°N 92°W Flimnap postać z Podróży Guliwera 60°N 350°W Grildrig postać z Podróży Guliwera 81°N 195°W Gulliver główny bohater Podróży Guliwera 62°N 163°W Hall Asaph Hall, odkrywca Fobosa 80°S 210°W Limtoc postać z Podróży Guliwera 11°S 54°W Reldresal postać z Podróży Guliwera 41°N 39°W Roche Édouard Roche, astronom 53°N 183°W Sharpless Bevan Sharpless, astronom 27,5°S 154°W Skyresh postać z Podróży Guliwera 52,5°N 320°W Stickney Angeline Stickney, żona Asapha Halla 1°N 49°W Todd David Peck Todd, astronom 9°S 153°W Wendell Oliver Wendell, astronom 1°S 132°W