Regularnie publikował swoje felietony w „Wiadomościach Kulturalnych”, „Przeglądzie Tygodniowym” i „Przeglądzie”. Od 1998 był prezesem zarządu głównego Polskiego Czerwonego Krzyża, ustąpił z tej funkcji w grudniu 2003. W 2001 po raz czwarty uzyskał mandat poselski z listy Sojuszu Lewicy Demokratycznej – Unii Pracy z okręgu warszawskiego.

Zmarł 26 stycznia 2004. Uroczystości pogrzebowe polityka odbyły się 31 stycznia tego samego roku; został pochowany w rodzinnym grobie na cmentarzu leśnym w Laskach.

Życie prywatne Wywodził się z rodziny szlacheckiej Małachowskich. Był synem Wacława Małachowskiego i Olgi z Kańskich. Z pierwszego małżeństwa z Krystyną Maciukiewicz miał dwóch synów – Sawę Wacława i Łukasza. Z drugą żoną Krystyną Woycicką miał syna Kajetana.

Odznaczenia i wyróżnienia Postanowieniem prezydenta Aleksandra Kwaśniewskiego z 9 grudnia 1999 został odznaczony, w uznaniu wybitnych zasług w działalności państwowej i publicznej, Krzyżem Wielkim Orderu Odrodzenia Polski.

W 1999 otrzymał Medal „Zasłużony dla Tolerancji”.