W czasie potopu szwedzkiego w 1657 roku wieś została zniszczona przez współpracujących ze Szwedami siedmiogrodzian Jerzego II Rakoczego. Kolejnych zniszczeń dokonały oddziały szwedzkie w czasie III wojny północnej w 1703 i w 1704 r., a następnie wojska zaborcze Austriaków w 1772 r., którzy przepędzali konfederatów barskich. W 1772 r. wybudowali oni tu za pomocą jeńców drogę murowaną z Dukli do Lwowa. Hrabia Ewaryst Andrzej Kuropatnicki w wydanym po raz pierwszy w 1786 r. dziełku pt. „Geografia (...) Galicyi i Lodomeryi” wspomniał wieś, która wówczas znajdowała się w cyrkule dukielskim: Zboiska. Wieś tym sławna, że na jej gruncie pierwszy most na rzece Jasionce, na drodze z Węgier do Lwowa, na arkadach dachem pokryty z facyatami murowany stanął.
W XIX w. Zboiska należały do Cezarego Męcińskiego, herbu Poraj (1809-przed 1890). 5 maja 1915 r. doszło tu do walki między dońskimi kozakami a Austriakami. Poległych pochowano na cmentarzu wojennym w Dukli, a Rosjan w lesie Popardy.
W czasie drugiej wojny światowej w tym lesie w leśniczówce Karniów był punkt przerzutowy na Węgry i punkt zborny Placówki Dalia AK. W czasie okrążenia udało się z niej uciec partyzantom: J. Kopcza - Waldemar, a Such - Mściciel i St. Karnia - Longinus, natomiast leśniczy Wojciech Karnia trafił do obozu w OranienburguStrona krosno.lasy.gov.pl s.