Udział w Mistrzostwach Świata 2002 Rok 2002 był rokiem, w którym Japonia wraz z Koreą Południową organizowała mistrzostwa świata. Niebiescy Samurajowie grali więc w grupie H razem z Belgią, Rosją i Tunezją. Po dwóch zwycięstwach (z Rosją 1:0 i Tunezją 2:0), oraz jednym remisie (2:2 z Belgią) zajęli pierwsze miejsce w grupie z siedmioma punktami i awansowali do kolejnej fazy turnieju. W 1/8 finału spotkali się z reprezentacją Turcji, z którą przegrali 0:1 i odpadli z turnieju.
Udział w Mistrzostwach Świata 2006 Turniej w Niemczech, Japonia zakończyła na fazie grupowej. Z jednym punktem na koncie po bezbramkowym remisie z Chorwacją i dwóch porażkach (z Australią 1:3 i Brazylią 1:4) zajęła ostatnie miejsce w grupie i odpadła z turnieju.
Udział w Mistrzostwach Świata 2010 Japończycy rozpoczęli swój udział w tej imprezie od wygranego 1:0 meczu z Kamerunem. Później przegrali z Holandią 0:1 oraz wygrali jeszcze z Danią 3:1. Pozwoliło im to zająć drugie miejsce w grupie E, i z sześcioma punktami na koncie awansować do 1/8 finału. W tej fazie turnieju trafili na reprezentację Paragwaju, której ulegli 3:5 po serii rzutów karnych.