Pod koniec 1982 Skrzypczak po raz pierwszy awansował – został dowódcą kompanii, czyli 16 czołgów T-55.
Akademia Sztabu Generalnego i Sztab Frontu Polskiego W październiku 1984 r. Waldemar Skrzypczak rozpoczął 3-letnie studia w Akademii Sztabu Generalnego. W 1987 Skrzypczak ukończył Akademię, chociaż na ostatnim roku mało brakowało, a nie zdałby egzaminu z naukowego komunizmu.
Po ukończeniu Akademii Sztabu Generalnego Skrzypczak, jako najzdolniejszy student na swoim roku, został zarekomendowany do służby w Sztabie Frontu Polskiego. Była to jednostka, która miała dowodzić wszystkimi polskimi armiami w czasie wojny z ZachodemOficjalnie jednostka ta nosiła nazwę Głównego Zarządu Szkolenia Bojowego Wojska Polskiego, a jej prawdziwa nazwa była utajniona, zaś pracujący tam oficerowie mieli zakaz przychodzenia do pracy w mundurach.. Oficer trafił do oddziału planowania operacyjnego.