Płyn mózgowo-rdzeniowy, guz, ropień, naczyniak wątroby i śledziona widoczne są jako jasne, a wątroba i trzustka jako ciemne. FLAIR (ang. ) – modyfikacja sekwencji T2-zależnej, w której obszary z małą ilością wody ukazywane są w ciemniejszych barwach, zaś obszary z dużą ilością wody w jaśniejszych. Obrazowanie w tej sekwencji znajduje zastosowanie w wykrywaniu chorób demielinizacyjnych. Obrazowanie dyfuzyjne – mierzy dyfuzję molekuł wody w tkance. Wyróżnia się tutaj techniki: obrazowanie tensora dyfuzji (DTI, ang. ), które może być zaadaptowane do obrazowania zmian w połączeniach istoty białej, oraz obrazowanie zależne od dyfuzji (DWI, ang. ), wykazujące dużą skuteczność w obrazowaniu udarów mózgu.
Uzupełnieniem techniki jest spektroskopia rezonansu magnetycznego in vivo, pozwalająca na uzyskiwanie widm rezonansu magnetycznego badanych obszarów organizmu.
Zagrożenia i przeciwwskazania Jeśli pacjent otrzymuje środek cieniujący, istnieje niewielkie ryzyko wystąpienia reakcji alergicznej, jest ono jednak mniejsze niż przy substancjach kontrastowych zawierających jod (powszechnie stosowanych do zdjęć rentgenowskich i tomografii komputerowej).