Oprócz flagi państwowej, cywilnej i wojennej, na Słowacji funkcjonuje sztandar prezydencki (Štandarda prezidenta Slovenskej republiky). W okresie Państwa Słowackiego i prezydentury Jozefa Tiso na kwadratowym białym płacie obszytym złotą frędzlą. Pośrodku znajdował się ówczesny herb Słowacji, nieznacznie różniący się od współczesnego. Poniżej znajdowało się osobiste motto ks. Tiso – Verní sebe svorne napred (Wierni sobie zgodnie naprzód). Oprócz innych ozdób, herb wraz z mottem otaczało dwanaście (po trzy na każdym boku) stylizowanych dwuramiennych krzyży. W narożnikach płata znajdowały się czerwone róże ze złotą strzałą. Podobny wizerunek kwiatu znajduje się w herbie Rużomberku – rodzinnego miasta Andreja Hlinki, a więc ojca słowackiego ruchu narodowego. Sztandar wprowadzono 19 października 1939. Przestał być używany z likwidacją Państwa słowackiego 8 maja 1945 roku.