W 1915 poślubiła Beauforta Burdekina, australijskiego adwokata i wioślarza olimpijskiego, który w czasie I wojny światowej służył we Francji. W okresie wojny Burdekin pracowała jako ochotnicza pielęgniarka, a według jednego ze źródeł pracowała w szpitalu wojskowym, gdy jej mąż został ranny podczas działań wojennych. Małżeństwo miało dwie córki: Katharine Jane (1917) i Helen Eugenie (1920). W 1920 rodzina przeniosła się do Sydney, jednak w 1921 Burdekin wróciła do Anglii wraz z córką; jej małżeństwo zakończyło się w tym okresie.
Po powrocie do Anglii zamieszkała w Minack Head w Kornwalii, gdzie dołączyła do swojej siostry , związanej z utworzeniem Minack Theatre. W 1926 poznała Isobel Allan-Burns, która została jej wieloletnią towarzyszką. Burdekin weszła również w środowisko literackie Londynu, w którym znajdowali się między innymi Havelock Ellis, Leonard i Virginia Woolf oraz Bertrand i .
Twórczość Pierwszą powieścią Burdekin była Anna Colquhoun, opublikowana w 1922. Utwór przedstawia kobietę, która rezygnuje z męża i kariery w ramach duchowej przemiany. Co prawdopodobnie miało odzwierciedlać problemy małżeńskie autorki.