Stosowanie leku wiązało się jednocześnie ze zwiększoną częstością działań niepożądanych, przede wszystkim senności.
Cyklobenzapryna nie jest skuteczna w leczeniu spastyczności wynikającej z chorób ośrodkowego układu nerwowego, w tym chorób mózgu i rdzenia kręgowego.
Fibromialgia 15 sierpnia 2025 roku FDA dopuściła do stosowania w Stanach Zjednoczonych podjęzykową postać chlorowodorku cyklobenzapryny pod nazwą handlową Tonmya do leczenia fibromialgii u dorosłych. Lek podaje się raz na dobę przed snem.
W metaanalizie czterech randomizowanych badań klinicznych obejmujących łącznie 1684 osoby podjęzykowa cyklobenzapryna zwiększała w porównaniu z placebo odsetek chorych uzyskujących co najmniej 30% i co najmniej 50% zmniejszenie natężenia bólu oraz poprawiała ogólną ocenę zmiany stanu zdrowia. Działania niepożądane występowały częściej niż w grupie placebo i były związane głównie z przejściowymi objawami w jamie ustnej.