Obszar portowy obejmuje trzy baseny, nabrzeża przeładunkowe, place składowe, magazyny, zbiorniki, silosy, bocznice kolejowe i drogi wewnętrzne. Port sąsiaduje bezpośrednio z zabudową miejską Kopru oraz z rezerwatem przyrody Škocjanski zatok, utworzonym na pozostałościach dawnych terenów podmokłych Zatoki Koperskiej.
Położenie w północnej części Adriatyku umożliwia obsługę towarów przewożonych pomiędzy portami Morza Śródziemnego i Azji a państwami Europy Środkowej. Port konkuruje o obsługę tego zaplecza między innymi z portem w Trieście, portem w Rijece i portem w Wenecji.
Historia Powstanie portu Do połowy XX wieku Koper pełnił przede wszystkim funkcję niewielkiego portu lokalnego. Głównym portem północno-wschodniego Adriatyku pozostawał Triest. Po II wojnie światowej Koper znalazł się w strefie B Wolnego Terytorium Triestu, administrowanej przez Jugosławię, a w 1954 roku został włączony do Jugosławii.
Decyzja o budowie nowego portu handlowego była związana z potrzebą utworzenia zaplecza morskiego dla Słowenii i północno-zachodniej części Jugosławii. W maju 1957 roku powołano przedsiębiorstwo Pristanišče Koper, odpowiedzialne za budowę i eksploatację portu.