W lutym 1945 objął funkcję kierownika Szkoły Podstawowej w Krzynowłodze Małej, a od września 1946 był kierownikiem szkoły w Węgrze. W 1949 podjął pracę w Szkole Podstawowej nr 1 w Przasnyszu. W roku szkolnym 1950/51 był instruktorem szkolenia przy zarządzie Oddziału Powiatowego ZNP. We wrześniu 1953 rozpoczął pracę jako nauczyciel chemii w Liceum Ogólnokształcącym w Przasnyszu. Jednocześnie uzupełniał wykształcenie, ukończył zaoczne studia w Wyższej Szkole Pedagogicznej w Gdańsku. W roku 1963 rozpoczął eksternistyczne studia magisterskie na wydziale chemicznym Uniwersytetu Mikołaja Kopernika w Toruniu, a egzamin magisterski złożył w czerwcu 1966.
Michał Obojski jako nauczyciel chemii Liceum Ogólnokształcącego w Przasnyszu w latach 50. założył pracownię chemiczną, która znajdowała się w sąsiednim budynku Szkoły Podstawowej nr 2, obok gabinetu lekarskiego. Dopiero po kilku latach udało się zorganizować w budynku LO pomieszczenie na własną pracownię chemiczną, która w kolejnych latach była jeszcze modernizowana. Podstawowym wyposażeniem pracowni były probówki w drewnianych statywach, a do ogrzewania ich zawartości służyły palniki spirytusowe w kształcie kałamarzy, z knotem i szklanym kołpakiem do zakrywania, kiedy ich się nie używało. Na lekcji taki zestaw stał na każdym uczniowskim stole.