W 1998 ukończył studia podyplomowe w Akademii Wojennej Sił Powietrznych USA, po czym otrzymał przydział służbowy na stanowisko zastępcy dowódcy 1 Brygady Lotnictwa Taktycznego – szefa szkolenia. W kwietniu 2000 objął funkcję szefa Oddziału Szkolenia Szefostwa Wojsk Lotniczych w Dowództwie Wojsk Lotniczych i Obrony Powietrznej. We wrześniu 2000 został zastępcą dowódcy 3 Korpusu Obrony Powietrznej.
W 2002 był mianowany na stopień generała brygady. Zastępca szefa WL SP. W 2004 był na stanowisku zastępcy szefa Generalnego Zarządu Rozpoznania Wojskowego SG WP. W latach 2007–2008 zastępca Dowódcy Operacyjnego Sił Zbrojnych. W okresie tym był także dowódcą grupy natychmiastowego reagowania NATO w bazie w Ramstein i dowódcą operacji powietrznych ISAF w Kabulu. 10 lutego 2010 w Ośrodku Reprezentacyjnym Ministerstwa Obrony Narodowej w podwarszawskim Helenowie minister obrony narodowej Bogdan Klich pożegnał gen. bryg. pil. Piotra Luśnię wraz z grupą generałów, w tym Zdzisław Goral, w związku z zakończeniem zawodowej służby wojskowej. W rezerwie był wykładowcą akademickim w Akademii Wojsk Lądowych we Wrocławiu, gdzie w 2017 rektor uczelni gen. bryg. Dariusz Skorupka rozwiązał z nim umowę oraz z innymi dowódcami, którzy jako profesorowie wizytujący wykładali na tej wojskowej uczelni.