Dalsze etapy fazy pucharowej pozostają bez zmian.
Miejsca dla federacji zostaną rozdzielone poprzez współczynnik ligowy UEFA z sezonu 2024/2025. W edycji 2026/2027 Ligi Europy może wziąć udział 77 zespołów (poza zespołami z Rosji, z powodu przeprowadzanej przez nią inwazji na Ukrainę oraz Liechtensteinu, gdzie nie były przeprowadzane krajowe mistrzowskie rozgrywki ligowe – drużyny piłkarskie z tego kraju należą do szwajcarskiego systemu ligowego). 45 drużyn z 32 najlepszych federacji kwalifikuje się bezpośrednio do Ligi Europy, natomiast pozostałe to zespoły, które odpadną z eliminacj do Ligi Mistrzów.
Prawo udziału w rozgrywkach uzyskają: zwycięzca w edycji 2025/2026 Ligi Konferencji UEFA (jeśli zdobywca tego trofeum uzyska miejsce w fazie ligowej Ligi Europy lub Ligi Mistrzów poprzez rozgrywki krajowe, jego miejsce zajmie klub fazy kwalifikacyjnej z najwyższym rankingiem klubowym UEFA), dwa zespoły z federacji z miejsc 1–12; po jednym zespole z federacji z miejsc 13–33 (poza Rosją); 32 drużyny wyeliminowane z Ligi Mistrzów UEFA