Było to jednak rozwiązanie tymczasowe, a ciasnota pomieszczeń, brak sali gimnastycznej i auli wymusiły decyzję o przeniesieniu siedziby szkoły do budynku przy ulicy Świerczewskiego 1. Liceum dzieliło pomieszczenia ze Szkołą Powszechną nr 2. W roku szkolnym 1948/1949 połączono szkołę powszechną z Liceum, tworząc Państwową Szkołę Ogólnokształcącą Stopnia Podstawowego i Licealnego, a czteroletnie liceum stało się częścią składową szkoły jedenastoletniej. 10 listopada 1950 w szkole założono Szkolne Koło Sportowe „Błyskawica” (w 1965 przemianowane na SKS „Chrobry”). Utworzono sekcję koszykówki i siatkówki.
Decyzją Kuratorium Okręgu Szkolnego w Zielonej Górze, 1 września 1958 nastąpiła kolejna zmiana nazwy szkoły. Odtąd była to Szkoła Podstawowa i Liceum Ogólnokształcące w Gubinie. Równolegle trwały prace adaptacyjne nowego obiektu przeznaczonego na potrzeby Liceum. Był to, zniszczony w czasie wojny, budynek niemieckiego liceum żeńskiego przy ulicy Piastowskiej 26. Przeniesienie do nowej siedziby nastąpiło w październiku 1959.