Od 2011 roku NFA realizuje ambitne projekty digitalizacyjne, obejmujące takie dzieła jak Małgorzata, córka Łazarza, Pali się, moja panno, Pociągi pod specjalnym nadzorem, Ikaria XB-1, Przypadek dla początkującego kata, Adelheid i inne.

NFA sprawuje opiekę nad ponad 150 milionami metrów taśmy filmowej, ponad 500 000 zdjęć, ponad 30 000 plakatów i 100 000 materiałów promocyjnych. Zbiory archiwalne i biblioteka filmowa służą profesjonalistom zajmującym się badaniami naukowymi i są źródłem informacji oraz materiałów dla współczesnej produkcji audiowizualnej. W latach 1965–2008 NFA zabezpieczyło prawie 24 miliony metrów taśmy filmowej skopiowanej z łatwopalnych materiałów. Czeskie Archiwum Filmowe zachowało ostatnie ocalałe kopie wielu filmów, które uznano za zaginione – Match de prestidigitation (1904), La Chaussette (1905), Amoreux de Madame (1909) Georges’a Mélièsa, Flowing Gold (1924), wersję Ben Hura (1925) w Technicolorze, Zaginiony świat (1925), Borrowed Finery (1925), Her Wild Oat (1927), It (1927), Now We’re In The Air (1927), najlepiej zachowaną