W sezonie 1963 ze względu na reformę rozgrywek tj. likwidację II ligi i powiększenie do dwóch grup I ligi gorzowianie – po pokonaniu w decydującym meczu Anilany Łódź, znaleźli się wśród najlepszych drużyn w kraju, zajmując w rozgrywkach jednak ostatnie miejsce. Podobnie było w następnym sezonie.
W 1965 roku z powodu kolejnej reorganizacji rozgrywek polegającej na zmniejszeniu I ligi do ośmiu drużyn gorzowscy waterpoliści po pierwszej połowie sezonu ponownie uczestniczyli w cyklu eliminacji o awans. Przeciwnikami Stilonu było siedem innych drużyn z I i II ligi: Śląsk Wrocław, Olimpia Poznań, Anilana Łódź, Ślęza Wrocław, Fortuna Bytom, Neptun Stargard Szczeciński i Górnik Zabrze. Awans wywalczyły jednak obydwie wrocławskie ekipy. Jesienią odbyły się kolejne eliminacje o wejście do rozgrywek I ligi sezonu 1966. Tym razem Stilonowcy wywalczyli awans, pokonując w trójmeczu barażowym Anilanę Łódź 2:1 (5:6, 5:1 i 6:2). Kolejne lata to ponownie zacięte boje gorzowskiej drużyny o utrzymanie. Po kolejnym spadku z I ligi w 1969 roku Stilonowcy znów musieli uczestniczyć w eliminacjach o awans szybko wracając do najwyższej klasy rozgrywkowej, pewnie pokonując na turnieju w Sosnowcu GKS Katowice 8:4, Neptuna Stargard Szczeciński 8:3 i MKS Szczecin 8:0.