Dalej dolina zwęża się i rozszerza, oddzielając Pogórze Izerskie od Pogórza Kaczawskiego, później przecina Bory Dolnośląskie, Wał Trzebnicki, Obniżenie Milicko-Głogowskie, Wzniesienia Zielonogórskie i dolinę środkowej Odry.
Uchodzi do Odry w okolicach Krosna Odrzańskiego.
Niektóre dopływy: Zadrna (prawy) Lesk (prawy) Hutniczy Potok (Miedziany Potok) (lewy) Krupówka (prawy) Janówka (lewy) Łomnica (lewy) Kamienna (lewy) Kamienica (lewy) Bobrzyca (prawy) Szprotawa (prawy), Kwisa (lewy) Czerna Wielka (lewy)
Wybrane miejscowości, przez które przepływa Bóbr (wytłuszczone miasto): Miejscowości, przez które przepływa BóbrPaństwoKraj/WojewództwoPowiatMiejscowość ↓ Czechy hradeckibezramki|23x23px Trutnovbezramki|25x25px Bobr (Žacléř) (źródło) Polska dolnośląskiebezramki|24x24px kamiennogórskibezramki|24x24px Lubawkabezramki|22x22px Kamienna Góra (na wysokości ul.