Początkowo założony w 1335 roku majątek rycerski Bartążek stanowił jedyną osadę o nazwie Bartąg (Bertyng). Po założeniu 10 lat później w jego sąsiedztwie czynszowej wsi o tej samej nazwie (dziś Bartąg), zaczęto je rozróżniać. Początkowo Bartążek znany był pod nazwą Bartąg Pruski (Preuschze Bertyng), a sąsiednia wieś zwana była Bartągiem Niemieckim (Deutsche Bertyng) ze względu na osadników z Turyngii. Z czasem nazwa Bartąg (niem. Bertung) przylgnęła do większej i parafialnej wsi (niem. Gross Bertung, dosł. Bartąg Wielki), więc dla odróżnienia dwór i znajdującą się przy nim osadę zaczęto nazywać Bartążkiem (niem. Klein Bertung, dosł. Bartąg Mały). Należący do majątku w Bartążku folwark nazywano zaś Nowym Bartągiem (niem. Neu Bertung) lub po polsku Owczarnią.
Historia mały|Bartążek (Kl. Bertung) na Mapie Świętej Warmii z 1755 roku Bartążek jest najstarszą miejscowością w okolicach Olsztyna. W czasach pruskich znajdowało się tutaj pole osadnicze (lauks) o nazwie Berting (Bertingen), leżące nad jeziorem o tej samej nazwie. Pole dało nazwę ziemi Bertingen, pruskiej jednostce osadniczej należącej do GalindiiGrzegorz Białuński Pruskie związki terytorialno-osadnicze w dorzeczu środkowej Łyny w XIII wieku, Komunikaty Warmińsko-Mazurskie nr 1, 2004, s. 3–17..